学校加强学科建设、专业建设、课程建设、教材建设、教学基地建设、师资队伍建设、实验设备和电化教学建设，实现教考分离，使学校的教学改革依照教改方案有条不紊地向前推进。1999年，学校参加了全国高等医学教育学会行政管理分会成立大会，并当选为辽宁省唯一的常务理事单位，全校教职医护员工为之鼓舞。
面对21世纪科技发展新形势，学校审时度势，加强了科技工作的领导和管理，使学校的科技事业得到了快速发展。
学校对科技档案实行了微机化管理，加强了对立项课题的中期清理和检查工作。1998年，全校申报课题47项，中标28项，获得科研经费50万元，完成课题22项，其中，鉴定成果14项。学校获省科技进步三等奖3项，省教委科技奖4项，申报市科技进步奖11项，发表学术论文200余篇。其中，在国外学术刊物上发表8篇，在国家级刊物上发表129篇，著书16部，获辽宁省第三届青年论文奖17篇。
1998年，学校还新增加了循环内科硕士点，至此，学校硕士点已经达到8个。
学校还新建了口腔颌面外科和外科中心研究室，审核批准了5名教师为硕士研究生导师，新确定了5个学科为1999年申报硕士点候选学科。
科技开发部研制的科技产品“脑维治”申报了国家新药，另一种新药“速止血”正在研究开发中。学校还和北京美术集团合作，成立了泰康生物工程有限责任公司，展示了良好的发展前景。
